RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUOXP51687 545 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERAP2Q6P179 960 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMTC1Q8IUR5 882 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OXR1Q8N573 874 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HCAR2Q8TDS4 363 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CXorf40AQ8TE69 158 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KLHDC7BQ96G42 594 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HAUS2Q9NVX0 235 aa20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KNL1Q8NG31 2342 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRD1A4D1F6 860 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YKT6O15498 198 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FLRT2O43155 660 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL4RP24394 825 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCNN1BP51168 640 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARSEP51690 589 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NXPH1P58417 271 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AP1S1P61966 158 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCL2L1Q07817 233 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ELP6Q0PNE2 266 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC73Q5JTD7 316 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRAT1Q6PJG6 821 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSKH2Q96QS6 385 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FZD3Q9NPG1 666 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITM2BQ9Y287 266 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGLON5A6NGN9 336 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAFKO60675 156 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NEBLO76041 1014 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THEGLP0DJG4 465 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNNT1P13805 278 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MX2P20592 715 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL9RQ01113 521 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC10A7Q0GE19 358 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCEAL1Q15170 157 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MARC1Q5VT66 337 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAMK1DQ8IU85 385 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RHOT1Q8IXI2 618 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM145Q8NBT3 493 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDH19Q8TAB3 1148 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CA5BQ9Y2D0 317 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLXNA2O75051 1894 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A0A1B0GTQ1 180 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MFSD11O43934 449 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHGA12O60330 932 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LCA5LO95447 670 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KRT1P04264 644 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIMP2P16035 220 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KDELR1P24390 212 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRK6P43250 576 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MMP13P45452 471 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGRP47804 291 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC38Q5VT99 294 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RHBDD1Q8TEB9 315 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAPGEF5Q92565 580 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAMK1GQ96NX5 476 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCUBE2Q9NQ36 999 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GGT7Q9UJ14 662 aa19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOWAHDA6NJG2 315 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A6NNZ2 444 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FPGTO14772 594 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AREL1O15033 823 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TM7SF2O76062 418 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NDUFA10O95299 355 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITGAVP06756 1048 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GARSP41250 739 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GALNT2Q10471 571 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UGP2Q16851 508 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa19.96■□□□□ 0.79
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAF2Q96CS3 445 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms