RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451218.6

USP46-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP46, Length 4,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-202ENST00000451218 GALPQ9UBC7 116 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 OR51F1A6NGY5 319 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CCL22O00626 93 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 LPXNO60711 386 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 S1PR4O95977 384 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 MT-CO1P00395 513 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 MYOGP15173 224 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 ARSAP15289 507 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CA4P22748 312 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 PEX6Q13608 980 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 TXNDC8Q6A555 127 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 DENND1CQ8IV53 801 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CCDC63Q8NA47 563 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 GPR150Q8NGU9 434 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 BIRC8Q96P09 236 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 EBF4Q9BQW3 602 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 ARL5AQ9Y689 179 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 INSIG1O15503 277 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 HMBSP08397 361 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CTHP32929 405 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CDH4P55283 916 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 ARPP19P56211 112 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 RAB15P59190 212 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 GNA12Q03113 381 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 POU6F1Q14863 301 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 PCID2Q5JVF3 399 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CNSTQ6PJW8 725 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 HTR3DQ70Z44 454 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 ABI1Q8IZP0 508 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 APCDD1Q8J025 514 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 SLC30A3Q99726 388 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 HCN2Q9UL51 889 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 MAFFQ9ULX9 164 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-202ENST00000451218 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 A0A1B0GTL3 188 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 BIRC5O15392 142 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 GPR39O43194 453 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 LATS1O95835 1130 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 SPATA31D3P0C874 917 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 CNTFP26441 200 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 GP5P40197 560 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 KCNJ2P63252 427 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 CDK18Q07002 472 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 OVGP1Q12889 678 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 TRAF2Q12933 501 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ODF2Q5BJF6 829 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ADGRF1Q5T601 910 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 GRTP1Q5TC63 336 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 HERVK_113Q902F9 699 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 VPS39Q96JC1 886 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ZNF599Q96NL3 588 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 NAT9Q9BTE0 207 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 COPG2Q9UBF2 871 aa6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 K7ERQ8 282 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 SNAP91O60641 907 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 CYP4F8P98187 520 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 CTBP1Q13363 440 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 PLD1Q13393 1074 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 INSCQ1MX18 579 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 LGI2Q8N0V4 545 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 ZNF558Q96NG5 402 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 FAM107BQ9H098 131 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 TMEM51Q9NW97 253 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 EPOPA6NHQ4 379 aa6.64□□□□□ -1.35
USP46-202ENST00000451218 H3BMM5 538 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms