RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	VPS51	Q9UID3	782 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	KCND3	Q9UK17	655 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TLK1	Q9UKI8	766 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	KCTD3	Q9Y597	815 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504		M0QYV0	167 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	DIAPH2	O60879	1101 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TM7SF2	O76062	418 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ADCY5	O95622	1261 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	LDLR	P01130	860 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	RHOC	P08134	193 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PNLIP	P16233	465 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ITIH2	P19823	946 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	HTR1B	P28222	390 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	GK	P32189	559 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	STK4	Q13043	487 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CUL4B	Q13620	913 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	E2F4	Q16254	413 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	KRT39	Q6A163	491 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ASB12	Q8WXK4	309 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TFAP2B	Q92481	460 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	C5orf34	Q96MH7	638 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMB7	Q99436	277 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	SPON2	Q9BUD6	331 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	DDA1	Q9BW61	102 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	SIK2	Q9H0K1	926 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CUEDC2	Q9H467	287 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB20	Q9NX57	234 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	LUZP4	Q9P127	313 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504	KL	Q9UEF7	1012 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A0D9SEW6	157 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504		A8MU76	341 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	PDXK	O00764	312 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KATNA1	O75449	491 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CLDN11	O75508	207 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	RFPL1	O75677	317 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	DNAJB5	O75953	348 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	FBXO21	O94952	628 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CALCA	P01258	141 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	LIMK2	P53671	638 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	LRMP	Q12912	555 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	IRF4	Q15306	451 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CARD16	Q5EG05	197 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KCTD16	Q68DU8	428 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TTC7B	Q86TV6	843 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC34A3	Q8N130	599 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	IQUB	Q8NA54	791 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TTC13	Q8NBP0	860 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB7B	Q96AH8	199 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	HSFY1	Q96LI6	401 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	APOO	Q9BUR5	198 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-222	ENST00000449504	RRN3	Q9NYV6	651 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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