RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442971.1

SSXP3-201, Transcript of SSX family pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SSXP3, Length 1,300 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSXP3-201ENST00000442971 PTK2Q05397 1052 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 DMPKQ09013 629 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 SQSTM1Q13501 440 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 KEAP1Q14145 624 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 NR1D2Q14995 579 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 MSS51Q4VC12 460 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 BRICD5Q6PL45 260 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 MACC1Q6ZN28 852 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 DPH6Q7L8W6 267 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 HID1Q8IV36 788 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 AZIN2Q96A70 460 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 LMLNQ96KR4 655 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 GPR87Q9BY21 358 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RNF32Q9H0A6 362 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.29□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 B4DGG1 531 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 M0R2N6 131 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 KIAA0754O94854 1291 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CDC25AP30304 524 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CA5AP35218 305 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CHRNA4P43681 627 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RRADP55042 308 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ECT2LQ008S8 904 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CCDC15Q0P6D6 951 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 WDR49Q8IV35 697 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 BICD1Q96G01 975 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 IL25Q9H293 177 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 NMUR1Q9HB89 426 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 LHX9Q9NQ69 397 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 IL17CQ9P0M4 197 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 PDP2Q9P2J9 529 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.28□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CUTAO60888 179 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 MED24O75448 989 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 UNC5CO95185 931 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RASGRP1O95267 797 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF18P17022 549 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 GPR3P46089 330 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 SGSHP51688 502 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 NDST2P52849 883 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF445P59923 1031 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 YPEL5P62699 121 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 SGCGQ13326 291 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 LAMB3Q13751 1172 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 FAM35AQ86V20 835 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 BLIDQ8IZY5 108 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 DAW1Q8N136 415 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 Q96MF0 132 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 CEP83Q9Y592 693 aa7.27□□□□□ -1.24
SSXP3-201ENST00000442971 SEC16AO15027 2179 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms