RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 MOCOSQ96EN8 888 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF186Q9NXI6 227 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM149AA5PLN7 773 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CCRL2O00421 344 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRA3O75311 464 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD10O75832 226 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IL18RAPO95256 599 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FYNP06241 537 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB1P30740 379 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRKG1Q13976 671 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1JQ5JR12 505 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SV2AQ7L0J3 742 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 HTRA1Q92743 480 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB9Q96DX5 294 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MED30Q96HR3 178 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD6Q96NE9 622 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ACCSQ96QU6 501 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM206Q9H813 350 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RMND5AQ9H871 391 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NEK6Q9HC98 313 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF358Q9NW07 568 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DLGAP1O14490 977 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 B4GAT1O43505 415 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NUAK1O60285 661 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TPST1O60507 370 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ARIH2O95376 493 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFB10O96000 172 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKCAP17252 672 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ11Q14654 390 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SPCS2Q15005 226 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCL1Q15111 1095 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 RFX6Q8HWS3 928 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PDPRQ8NCN5 879 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP90Q8TF47 636 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX19Q92543 992 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 APBB2Q92870 758 aa8.48□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR25O00155 361 aa8.47□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 JAG1P78504 1218 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 STILQ15468 1287 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP78Q5JTW2 689 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NPNTQ6UXI9 565 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA18Q8TC71 538 aa8.47□□□□□ -1.05
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