RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 EXOC2Q96KP1 924 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM7Q9C029 511 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PARVAQ9NVD7 372 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 DKK3Q9UBP4 350 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.36■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 J3KR12 359 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TIMP2P16035 220 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PSMA2P25787 234 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 HTR7P34969 479 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PRKCIP41743 596 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 E2F1Q01094 437 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 RAD51Q06609 339 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PDZD3Q86UT5 571 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.35■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 A0A1B0GTH6 734 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 A0A1W2PQC6 194 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TSPAN11A1L157 253 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 NEMP2A6NFY4 417 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 MMP20O60882 483 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PIGNO95427 931 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 ALPPL2P10696 532 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 NDST2P52849 883 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 ASIC2Q16515 512 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 HS1BP3Q53T59 392 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.34■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-8■■■□□ 15.2
HLA-B-250ENST00000434333 PRAMEF11O60813 436 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TM7SF2O76062 418 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 MT-CO3P00414 261 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 AFMIDQ63HM1 303 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 VPS36Q86VN1 386 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 RBFAQ8N0V3 343 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 CRELD1Q96HD1 420 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HLA-B-250ENST00000434333 SMTNL1A8MU46 457 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 H3BM21 787 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 AQP9O43315 295 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 OPA1O60313 960 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 GZMAP12544 262 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 JUNDP17535 347 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 DESP17661 470 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 RGRP47804 291 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 SEMG2Q02383 582 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 IQCB1Q15051 598 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 GP1BAP07359 652 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 ERCC2P18074 760 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 MIPP30301 263 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF165P49910 485 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 YPEL5P62699 121 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 RFX8Q6ZV50 586 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 NPWQ8N729 165 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 USP29Q9HBJ7 922 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 DONSONQ9NYP3 566 aa20.31■□□□□ 0.84
HLA-B-250ENST00000434333 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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