RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQU0 124 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 P4HA2O15460 535 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FFAR2O15552 330 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 OPA1O60313 960 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PIAS2O75928 621 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KRT5P13647 590 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ACTN2P35609 894 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 NUCB2P80303 420 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SULT2A1Q06520 285 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 OVGP1Q12889 678 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PDCLQ13371 301 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FGL2Q14314 439 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ACCSLQ4AC99 568 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ALFQ53S48 1182 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SMARCE1Q969G3 411 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 BMFQ96LC9 184 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 THAP9Q9H5L6 903 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DDIT4Q9NX09 232 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MEGF11A6BM72 1044 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ALOX15BO15296 676 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RAD51BO15315 384 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 THAP12O43422 761 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PAGE1O75459 146 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 NEBLO76041 1014 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ERBB2P04626 1255 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CKMT1AP12532 417 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KRT10P13645 584 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PTMSP20962 102 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RRM1P23921 792 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CDC25BP30305 580 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GNA15P30679 374 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CHRNA3P32297 505 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT1P36639 197 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 NNMTP40261 264 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 STX17P56962 302 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DAB2P98082 770 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 E2F1Q01094 437 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CFHR1Q03591 330 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HYAL2Q12891 473 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MEA1Q16626 185 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 C5orf22Q49AR2 442 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 LINGO4Q6UY18 593 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HORMAD1Q86X24 394 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PASD1Q8IV76 773 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 NELFBQ8WX92 580 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 VOPP1Q96AW1 172 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 APOLD1Q96LR9 279 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MED15Q96RN5 788 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 CALN1Q9BXU9 219 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 PREBQ9HCU5 417 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 GPR27Q9NS67 375 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 VPS51Q9UID3 782 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 VPS28Q9UK41 221 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 MGAQ8IWI9 3026 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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