RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 PDZD2O15018 2839 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 WIPF3A6NGB9 483 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 EFCAB7A8K855 629 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 NEMP1O14524 444 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 MMP20O60882 483 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 RASGRP1O95267 797 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 CPNE6O95741 557 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 SLC2A3P11169 496 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 CCR1P32246 355 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 SEPT6Q14141 434 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 TAF5Q15542 800 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 MAP9Q49MG5 647 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 CARD16Q5EG05 197 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 ART4Q93070 314 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 DDA1Q9BW61 102 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 CEP44Q9C0F1 390 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.65□□□□□ -0.54
DDX39B-209ENST00000428450 LRP4O75096 1905 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ZMPSTE24O75844 475 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 RHOCP08134 193 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 GKP32189 559 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ARHGEF7Q14155 803 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 IRF4Q15306 451 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 STILQ15468 1287 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ENPP7Q6UWV6 458 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 CPT1CQ8TCG5 803 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 PAGE5Q96GU1 130 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ST7Q9NRC1 585 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 DDIT4Q9NX09 232 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 SERTAD1Q9UHV2 236 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 MTMR6Q9Y217 621 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 AKAP9Q99996 3911 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 HIVEP1P15822 2718 aa11.64□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 TTLL8A6PVC2 850 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 STX10O60499 249 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 PAGE1O75459 146 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 TM7SF2O76062 418 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 CD160O95971 181 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ACADSBP45954 432 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 DNA2P51530 1060 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 LIMK2P53671 638 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 OR1D5P58170 312 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 LRMPQ12912 555 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 CUL4AQ13619 759 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 NFATC4Q14934 902 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 EDRF1Q3B7T1 1238 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 AMZ1Q400G9 498 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ARTNQ5T4W7 220 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ASB18Q6ZVZ8 466 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM110Q86TL2 294 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 OR7D4Q8NG98 312 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 HAPLN3Q96S86 360 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 THAP9Q9H5L6 903 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 COX16Q9P0S2 106 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.63□□□□□ -0.55
DDX39B-209ENST00000428450 DRGXA6NNA5 263 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms