RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PLOD3O60568 738 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 PEX10O60683 326 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 SPOCK2Q92563 424 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 USP17L7P0C7H9 530 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 PROSER1Q86XN7 944 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 ARL15Q9NXU5 204 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 H7C4K7 107 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 RXRGP48443 463 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SEPHS1P49903 392 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CCR3P51677 355 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CCL23P55773 120 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TAS2R40P59535 323 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PUDPQ08623 228 aa14.59□□□□□ -0.07
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