RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANXA6P08133 673 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOQP17081 205 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLN3Q13286 438 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPIDRQ14159 915 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMK4Q16566 473 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDO1Q16878 200 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL13BQ3SXY8 428 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VWA3BQ502W6 1294 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB6CQ53S08 254 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIIPQ5JXC2 388 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA35Q5VZE5 725 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM114A1Q8IWE2 563 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPA5Q8WXQ8 436 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLPBQ9H078 707 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB6CQ9H0N0 254 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEH1Q9H213 219 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRP4O75096 1905 aa13.35□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YY2O15391 372 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP20O60882 483 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMEP08473 750 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA2BP08514 1039 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSHRP16473 764 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADRA1BP35368 520 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPARDQ03181 441 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYLK3Q32MK0 819 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAXCQ5TGI0 409 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDPD4Q6W3E5 623 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL10Q8N8L6 244 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLKLQ8NB16 471 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPS8L1Q8TE68 723 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D31Q96DN5 1066 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED8Q96G25 268 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPAS1Q99814 870 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PADI4Q9UM07 663 aa13.34□□□□□ -0.27
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO18BQ8IUG5 2567 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8VZ95 297 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM72CH0Y354 149 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCC1O94876 653 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRIG2O94898 1065 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGSF6O95976 241 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCHL3P15374 230 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDC4P31431 198 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLKP51451 505 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF4Q15306 451 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL40Q2TBA0 621 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM72AQ5TYM5 149 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM72DQ6L9T8 149 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC7BQ86TV6 843 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM72BQ86X60 149 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RXFP2Q8WXD0 754 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOLKQ9UPQ8 538 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRK1Q38SD2 2015 aa13.33□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDELR3O43731 214 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD51Q06609 339 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOCQ15369 112 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC14Q49A88 953 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STRADAQ7RTN6 431 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC185Q8N715 623 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KYQ8NBH2 561 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDH19Q8TAB3 1148 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTYH3Q9C0H2 523 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRPGQ9P1W8 387 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DKK3Q9UBP4 350 aa13.32□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.31□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 D6RAR5 112 aa13.31□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLD2O14939 933 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms