RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 THAP2Q9H0W7 228 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZWILCHQ9H900 591 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SP110Q9HB58 689 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPR27Q9NS67 375 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNAJC28Q9NX36 388 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IFNKQ9P0W0 207 aa13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM149AA5PLN7 773 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NEMP2A6NFY4 417 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 H3BRJ5 948 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DFFAO00273 331 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM38O00635 465 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SIGLEC6O43699 453 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MMP20O60882 483 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PIAS2O75928 621 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TM7SF2O76062 418 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PIGNO95427 931 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPNS1P04632 268 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TPM3P06753 285 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ALPPL2P10696 532 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IL1R2P27930 398 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARL4AP40617 200 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IL10RBQ08334 325 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ELP6Q0PNE2 266 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ILKQ13418 452 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FZD2Q14332 565 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFAP58Q5T655 872 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MARCH9Q86YJ5 346 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR4C6Q8NH72 309 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSPH1Q92598 858 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UCKL1Q9NWZ5 548 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.51□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A0A087X0T9 212 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 H3BM21 787 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FFAR2O15552 330 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CSF2P04141 144 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GYPCP04921 128 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP1A2P05177 515 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM228BP0C875 321 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JUPP14923 745 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITIH2P19823 946 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ACP1P24666 158 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNF1BP35680 557 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CSNK1DP48730 415 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PFN3P60673 137 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DPYSQ14117 519 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DPYSL2Q16555 572 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UGP2Q16851 508 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMTNL2Q2TAL5 461 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PROX2Q3B8N5 592 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM52BQ4KMG9 183 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF542PQ5EBM4 170 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC122Q5T0U0 273 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BRAT1Q6PJG6 821 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PARGQ86W56 976 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PROSER1Q86XN7 944 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NPWQ8N729 165 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NIPA2Q8N8Q9 360 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CENPTQ96BT3 561 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NLGN3Q9NZ94 848 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IP6K2Q9UHH9 426 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ANAPC7Q9UJX3 599 aa13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSPAN11A1L157 253 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRABD2BA6NFA1 517 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYO1FO00160 1098 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TAF4O00268 1085 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TOR1BO14657 336 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCAMP1O15126 338 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RARAP10276 462 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SERPINA4P29622 427 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RGRP47804 291 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RENBPP51606 427 aa13.49□□□□□ -0.25
SIX3-AS1-201ENST00000419364 YPEL5P62699 121 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms