RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 KRTAP10-9P60411 292 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 PKP1Q13835 747 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 ME3Q16798 604 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 TXNDC8Q6A555 127 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-207ENST00000418674 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-207ENST00000418674 TRIM73Q86UV7 250 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-207ENST00000418674 TAF11Q15544 211 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-207ENST00000418674 ATG9BQ674R7 924 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-207ENST00000418674 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-207ENST00000418674 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-207ENST00000418674 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-207ENST00000418674 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.05□□□□□ -1.92
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