RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 LXNQ9BS40 222 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF747Q9BV97 191 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KCND1Q9NSA2 647 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RGL1Q9NZL6 768 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LRRK2Q5S007 2527 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 CAPN9O14815 690 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 CRHR1P34998 444 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 MGAT5Q09328 741 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 Q4G0T1 1027 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 EMC10Q5UCC4 262 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 UROC1Q96N76 676 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 TMEM74BQ9NUR3 256 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 Q9UFV3 132 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRK-210ENST00000415055 TMEM131Q92545 1883 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FLNCQ14315 2725 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NUMA1Q14980 2115 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SCN1AP35498 2009 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TSC2P49815 1807 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 A0A087WV62 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 A0A087WWV3 80 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRABD2BA6NFA1 517 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SYN3O14994 580 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FFAR2O15552 330 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SLC37A4O43826 429 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 EDIL3O43854 480 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ALDH1A2O94788 518 aa4.84□□□□□ -1.63
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