RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.3■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC39A13Q96H72 371 aa23.3■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 ASB3Q9Y575 518 aa23.3■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB26Q9HCK0 441 aa23.3■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 PGAM4Q8N0Y7 254 aa23.29■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.29■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 H3BNX3 289 aa23.29■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 IFT43Q96FT9 208 aa23.29■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.29■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 SLC14A2Q15849 920 aa23.28■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 TECRLQ5HYJ1 363 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 CNSTQ6PJW8 725 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 NUP93Q8N1F7 819 aa23.28■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 RCN3Q96D15 328 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 NT5MQ9NPB1 228 aa23.28■■□□□ 1.32
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPT4O43236 478 aa23.27■■□□□ 1.32
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.26■■□□□ 1.31
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RABGGTA-202ENST00000399409 ASGR1P07306 291 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-202ENST00000399409 OR4Q2P0C623 313 aa23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-202ENST00000399409 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RABGGTA-202ENST00000399409 ART3Q13508 389 aa23.26■■□□□ 1.31
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