RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 LHPPQ9H008 270 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 DECR2Q9NUI1 292 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 BABAM1Q9NWV8 329 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 ABI3Q9P2A4 366 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 MKLN1Q9UL63 735 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-190P-201ENST00000384154 A0A1W2PRG0 241 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 IFNL4K9M1U5 179 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 HSPB6O14558 160 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC25A17O43808 307 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PAGE4O60829 102 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TOMM40O96008 361 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TFP02787 698 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCNAP12004 261 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SRD5A1P18405 259 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TM4SF1P30408 202 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDAP32320 146 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP3CCP48454 512 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 POLD2P49005 469 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDH12P55289 794 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 EPHA10Q5JZY3 1008 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLEC4GQ6UXB4 293 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ENGASEQ8NFI3 743 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 GJC3Q8NFK1 279 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 LPAR1Q92633 364 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 INPP5DQ92835 1189 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNAPC3Q92966 411 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 BBS4Q96RK4 519 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITPAQ9BY32 194 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUF2Q9BZD4 464 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 FZD3Q9NPG1 666 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 A3GALT2U3KPV4 340 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 WDR91A4D1P6 747 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIPT2A6NK58 231 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 STMND1H3BQB6 276 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOCS2O14508 198 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLK8O60259 260 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZBED4O75132 1171 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NDUFB8O95169 186 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITGAXP20702 1163 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 GNLYP22749 145 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHATP28329 748 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PBX3P40426 434 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 MLH1P40692 756 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CXCR3P49682 368 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 DRG2P55039 364 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 RUNX2Q13950 521 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 VEPH1Q14D04 833 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCNG2Q16589 344 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 GSTA3Q16772 222 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF284Q2VY69 593 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ESCO2Q56NI9 601 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 HAUS3Q68CZ6 603 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 RBFAQ8N0V3 343 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 NRACQ8N912 160 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 CEP76Q8TAP6 659 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 OTULINQ96BN8 352 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-190P-201ENST00000384154 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms