RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 CENPAP49450 140 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPARAQ07869 468 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SHKBP1Q8TBC3 707 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC45A3Q96JT2 553 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 UROC1Q96N76 676 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 AP4E1Q9UPM8 1137 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MYH6P13533 1939 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ITM2AO43736 263 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LILRB5O75023 590 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SC5DO75845 299 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FGGP02679 453 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL7P13232 177 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LAG3P18627 525 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GNAZP19086 355 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CALCRP30988 508 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TPTEP56180 551 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NCS1P62166 190 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ST3GAL1Q11201 340 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PKP1Q13835 747 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DMC1Q14565 340 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TCEAL1Q15170 157 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DNLZQ5SXM8 178 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PIGSQ96S52 555 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRPC4Q9UBN4 977 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNJ14Q9UNX9 436 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TLR2O60603 784 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RARBP10826 455 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNA5P22460 613 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTPN5P54829 565 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GNA13Q14344 377 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KIZQ2M2Z5 673 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MYLPFQ96A32 169 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTCHD1Q96NR3 888 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 OPALINQ96PE5 141 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TCF25Q9BQ70 676 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CD274Q9NZQ7 290 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DLC1Q96QB1 1528 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNPLA6Q8IY17 1366 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MSH4O15457 936 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRODHO43272 600 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHST10O43529 356 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 BBOX1O75936 387 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ODC1P11926 461 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CTBP2P56545 445 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCNA1P78396 465 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GRAPQ13588 217 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DUSP7Q16829 419 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MYLK3Q32MK0 819 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 AFMIDQ63HM1 303 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 DGKHQ86XP1 1220 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RIOX2Q8IUF8 465 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CRELD1Q96HD1 420 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 S100A14Q9HCY8 104 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 C12orf71A8MTZ7 269 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 M0R233 179 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 IMPA2O14732 288 aa3.47□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPAA1O43292 621 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms