RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 DDI2Q5TDH0 399 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 METRNLQ641Q3 311 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POU5F2Q8N7G0 328 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C7orf57Q8NEG2 295 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POC1BQ8TC44 478 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHMP6Q96FZ7 201 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TCF7L2Q9NQB0 619 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT8Q9NY28 637 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PCSK1NQ9UHG2 260 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HPCAL4Q9UM19 191 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GW55 424 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OR6C76A6NM76 312 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EFCAB8A8MWE9 144 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WIPF1O43516 503 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RRP9O43818 475 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NTRK1P04629 796 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUX4L2P0CJ85 424 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUX4L3P0CJ86 424 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUX4L4P0CJ87 422 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUX4L5P0CJ88 424 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUX4L6P0CJ89 424 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUX4L7P0CJ90 424 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARL3P36405 182 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MDH1P40925 334 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLCNKBP51801 687 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CTAG1AP78358 180 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TEFQ10587 303 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CHIT1Q13231 466 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATMQ13315 3056 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CEP85Q6P2H3 762 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL24Q6TFL4 600 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC91Q7Z6B0 441 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC14AQ86T13 490 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GLB1L2Q8IW92 636 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C4orf19Q8IY42 314 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ELMOD2Q8IZ81 293 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM109AQ8N4B1 249 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DTX3Q8N9I9 347 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POMGNT2Q8NAT1 580 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D5Q92609 795 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SMARCE1Q969G3 411 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RAB7BQ96AH8 199 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MISP3Q96FF7 219 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMX3Q96JJ7 454 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CAPZA3Q96KX2 299 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SMC6Q96SB8 1091 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD6Q9BV23 337 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IKZF4Q9H2S9 585 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MARCH2Q9P0N8 246 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DUX4Q9UBX2 424 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC45A2Q9UMX9 530 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SNX14Q9Y5W7 946 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HEG1Q9ULI3 1381 aa2.58□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GVM2 712 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TUBAL3A6NHL2 446 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA8JA6NMD2 632 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM86B1E9PN63 330 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLIC2O15247 247 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GMNNO75496 209 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RECQL4O94761 1208 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VNN2O95498 520 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SKILP12757 684 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ACADLP28330 430 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AKT1P31749 480 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP25P42331 645 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GPD2P43304 727 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PSMC4P43686 418 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1024LP59773 190 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SP2Q02086 613 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ACAP1Q15027 740 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TBRG1Q3YBR2 411 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TCERG1LQ5VWI1 586 aa2.57□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZAR1Q86SH2 424 aa2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms