RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365447.1

RNU1-84P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 84, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-84P, Length 164 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-84P-201ENST00000365447 CSNK1DP48730 415 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 RENBPP51606 427 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 MAXP61244 160 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 BNC1Q01954 994 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 RAD51Q06609 339 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ADCY2Q08462 1091 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 KIF5AQ12840 1032 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 GRM3Q14832 879 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 LLGL1Q15334 1064 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 KAZNQ674X7 775 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 EXD1Q8NHP7 514 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 MAML1Q92585 1016 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ALG3Q92685 438 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 RMDN1Q96DB5 314 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 SERAC1Q96JX3 654 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 SLC6A18Q96N87 628 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 OLFM3Q96PB7 478 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 LGMNQ99538 433 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 RP1P56715 2156 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 A0A1B0GVT2 93 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 A0A1W2PQU0 124 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CCDC66A2RUB6 948 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 KCNK1O00180 336 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 AREL1O15033 823 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 MATN3O15232 486 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CST8O60676 142 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PCDH8O95206 1070 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 WNT1P04628 370 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PRKCGP05129 697 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 HLA-DQB2P05538 268 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CCDC175P0C221 793 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CCNB1P14635 433 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CCNCP24863 283 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 SERPINA4P29622 427 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 MMP12P39900 470 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 MAPK8P45983 427 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 GRIA4P48058 902 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PEX5P50542 639 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 SCNN1BP51168 640 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 LIMK1P53667 647 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 AP1S1P61966 158 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ARHGAP8P85298 464 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 DSC2Q02487 901 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TRAF2Q12933 501 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 GRIK2Q13002 908 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ZBTB17Q13105 803 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 TFDP2Q14188 446 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 FGL2Q14314 439 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 PPP2R5EQ16537 467 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ZNF284Q2VY69 593 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 CFAP58Q5T655 872 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 STPG1Q5TH74 334 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 MARC1Q5VT66 337 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU1-84P-201ENST00000365447 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms