RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DYRK1BQ9Y463 629 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GLP2RO95838 553 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 AMPD1P23109 780 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TM4SF1P30408 202 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA3AQ14563 771 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF827Q17R98 1081 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NIPA2Q8N8Q9 360 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SIAEQ9HAT2 523 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 WNK3Q9BYP7 1800 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ASLP04424 464 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ASGR1P07306 291 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NR2F6P10588 404 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PTGS2P35354 604 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 IL1RL1Q01638 556 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP69Q49AA0 526 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ITFG1Q8TB96 612 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MCUBQ9NWR8 336 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 OR14I1A6ND48 311 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PDHXO00330 501 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SEC24AO95486 1093 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ANPEPP15144 967 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FGFR2P21802 821 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DGKAP23743 735 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GUCY1A2P33402 732 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 BNIP1Q12981 228 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB6Q15916 424 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CERS6Q6ZMG9 384 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM17Q86X19 198 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAM13CQ8NE31 585 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 KIFC1Q9BW19 673 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CD274Q9NZQ7 290 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 C2CD2Q9Y426 696 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ETS1P14921 441 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DRD4P21917 467 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 HNF4AP41235 474 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ST8SIA6P61647 398 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PID1Q7Z2X4 250 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MDM1Q8TC05 714 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GANCQ8TET4 914 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 YME1L1Q96TA2 773 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NANSQ9NR45 359 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 POLLQ9UGP5 575 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WZ62 844 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQ72 361 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT3HB4E1H0 165 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 STK25O00506 426 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CAND2O75155 1236 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 NELL1Q92832 810 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC41A3Q96GZ6 507 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 WDR18Q9BV38 432 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 HCN3Q9P1Z3 774 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 CKLFQ9UBR5 152 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms