RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE3AQ05086 875 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD4Q8WVF5 259 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 USP7Q93009 1102 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DEC1Q9P2X7 70 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQ67 120 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNT3Q14435 633 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PDK4Q16654 411 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO19Q96H55 970 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL5CA6NH57 179 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BIRC5O15392 142 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LGR5O75473 907 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 C1RP00736 705 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA6P08133 673 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 HK2P52789 917 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 C1DQ13901 141 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 INVSQ9Y283 1065 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 OTCP00480 354 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 INHAP05111 366 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CNPP09543 421 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 AMD1P17707 334 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CTPS1P17812 591 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TPSB2P20231 275 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIA4P48058 902 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PTP4A2Q12974 167 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CTBP1Q13363 440 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TPSAB1Q15661 275 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT73Q86Y46 540 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOJQ9H4E5 214 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 VWA7Q9Y334 891 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 IFT172Q9UG01 1749 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf60A6NFR6 353 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ELFN1P0C7U0 828 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SPIDRQ14159 915 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TTMPQ5BVD1 217 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PMF1Q6P1K2 205 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM228AQ86W67 206 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 HDAC3O15379 428 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX3O60493 162 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PCYT1AP49585 367 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKCZQ05513 592 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BST1Q10588 318 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PACS1Q6VY07 963 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF145Q96MT1 663 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 UBXN8O00124 270 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3BGRLO75368 114 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LCA5LO95447 670 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CBX6O95503 412 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PROCP04070 461 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 LRPAP1P30533 357 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MC4RP32245 332 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NPY5RQ15761 445 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC142Q17RM4 750 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PROX1Q92786 737 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX15Q9NRS6 342 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 XPR1Q9UBH6 696 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 MEI4A8MW99 385 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA31D3P0C874 917 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 JAM2P57087 298 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 PLD5Q8N7P1 536 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP28Q8NHY6 868 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 ITFG1Q8TB96 612 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP44Q9C0F1 390 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms