RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MGAQ8IWI9 3026 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 AQP9O43315 295 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TPI1P60174 286 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 E2F1Q01094 437 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TYRO3Q06418 890 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TCEA2Q15560 299 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CDKN3Q16667 212 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CA9Q16790 459 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PARP15Q460N3 678 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 GUSBP11Q6P575 273 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 IFI44Q8TCB0 444 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PEBP4Q96S96 227 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SYT11Q9BT88 431 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC61Q9BV99 259 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.04■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ATMQ13315 3056 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 NEMP2A6NFY4 417 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TEX33O43247 280 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CSO75390 466 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MPOP05164 745 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 FERP16591 822 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 THOP1P52888 689 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 IRF4Q15306 451 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TTC7BQ86TV6 843 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 FAM181AQ8N9Y4 354 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CENPTQ96BT3 561 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DUSP23Q9BVJ7 150 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TRIM7Q9C029 511 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PDFQ9HBH1 243 aa16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC53A6NM62 1247 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 WASH4PA8MWX3 477 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 J3KR12 359 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 GCATO75600 419 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TM7SF2O76062 418 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PRKCGP05129 697 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TIMP2P16035 220 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PSMA2P25787 234 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RGRP47804 291 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RAD51Q06609 339 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MAMLD1Q13495 774 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 C1orf61Q13536 156 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ACAP1Q15027 740 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CYTH1Q15438 398 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 TBC1D25Q3MII6 688 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MAPK15Q8TD08 544 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 ASB12Q8WXK4 309 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC19Q9H756 370 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.02■□□□□ 0.16
SYCE1-202ENST00000343131 CPED1A4D0V7 1026 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 USP12O75317 370 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 GP1BAP07359 652 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 C6P13671 934 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 TGM2P21980 687 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 AIF1P55008 147 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 GABREP78334 506 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 MACC1Q6ZN28 852 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.01■□□□□ 0.15
SYCE1-202ENST00000343131 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms