RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FZD6O60353 706 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ERLIN1O75477 346 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM63AO94886 807 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 APRTP07741 180 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 UQCRHP07919 91 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CD86P42081 329 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 RGRP47804 291 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SOX9P48436 509 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ARL4CP56559 192 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 STARD6P59095 220 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 MAXP61244 160 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 DSC2Q02487 901 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 RAD51Q06609 339 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ITKQ08881 620 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SLMAPQ14BN4 828 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 MYLK3Q32MK0 819 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TTC8Q8TAM2 541 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 PTPRN2Q92932 1015 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CAVIN3Q969G5 261 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 VOPP1Q96AW1 172 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TRIB3Q96RU7 358 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FMO2Q99518 471 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FBRSQ9HAH7 460 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NOD2Q9HC29 1040 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 HCN2Q9UL51 889 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NFU1Q9UMS0 254 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 MAGEB16A2A368 324 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ALADP13716 330 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TSHRP16473 764 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 HLA-DPA1P20036 260 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NPY2RP49146 381 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 LMAN1P49257 510 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SCNN1BP51168 640 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 WNT3AP56704 352 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CDK18Q07002 472 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CDH17Q12864 832 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF234Q14588 700 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 IHHQ14623 411 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FAXCQ5TGI0 409 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CENPUQ71F23 418 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF534Q76KX8 674 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 PDIK1LQ8N165 341 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TMIEQ8NEW7 156 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FAM3CQ92520 227 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SHDQ96IW2 340 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SERPINB12Q96P63 405 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NELL2Q99435 816 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 GABRG3Q99928 467 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 C19orf43Q9BQ61 176 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NAT9Q9BTE0 207 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 PPIL1Q9Y3C6 166 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TSPAN11A1L157 253 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TTC34A8MYJ7 566 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 NDST3O95803 873 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 FGF1P05230 155 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 MYBL2P10244 700 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SERPINA4P29622 427 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 IL12RB1P42701 662 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 SUOXP51687 545 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 BCL2L1Q07817 233 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 CCINQ13939 588 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-202ENST00000317118 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
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