RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.34■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ALOX15BO15296 676 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 AVILO75366 819 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00032P0C843 101 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM22K7EJ46 135 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CATP04040 527 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 EPORP19235 508 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R40P59535 323 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTN2Q02246 1040 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ERGIC3Q9Y282 383 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 MEGF6O75095 1541 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 WSCD1Q658N2 575 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 CMTM6Q9NX76 183 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 XPR1Q9UBH6 696 aa24.33■■□□□ 1.49
GNPTAB-201ENST00000299314 ULK1O75385 1050 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKAG1P54619 331 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SCIMPQ6UWF3 145 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CDYL2Q8N8U2 506 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RTKNQ9BST9 563 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL8BQ9NVJ2 186 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC17A7Q9P2U7 560 aa24.33■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 UQCRBP14927 111 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 GOT1P17174 413 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 NOMO3P69849 1222 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PROSER1Q86XN7 944 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SHC3Q92529 594 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC47A1Q96FL8 570 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CCR4P51679 360 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC20A2Q08357 652 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND5AQ6IQ26 1287 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RGL2O15211 777 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 IL12AP29459 219 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ABL2P42684 1182 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TTPAP49638 278 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF19AQ9NV58 838 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 HLA-DQA2P01906 255 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PSEN2P49810 448 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA14Q0VDF9 509 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 BPIFA1Q9NP55 256 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH12Q9NPG4 1184 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SSNA1O43805 119 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP3A7P24462 503 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGFRNQ9P2B2 879 aa24.32■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PDHXO00330 501 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF222Q9UK12 451 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS4AQ9UN37 437 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP8P85298 464 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC15A2Q16348 729 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PACS1Q6VY07 963 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 HSFY1Q96LI6 401 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC38A2Q96QD8 506 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 FNBP1LQ5T0N5 605 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2E3Q969T4 207 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A088AWK7 358 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PARP8Q8N3A8 854 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.31■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 FGRP09769 529 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 NELFEP18615 380 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF232Q9UNY5 417 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 AZIN1O14977 448 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 IDO1P14902 403 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 RCVRNP35243 200 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 TUFMP49411 452 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 SPIBQ01892 262 aa24.3■■□□□ 1.48
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms