RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 PHKG1Q16816 387 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SELENOMQ8WWX9 145 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 E7ENQ6 273 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SPATA6LQ8N4H0 392 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 RDH11Q8TC12 318 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 FIG4Q92562 907 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SDCBP2Q9H190 292 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 ACSL4O60488 711 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 RRM2P31350 389 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.4■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 TCHHQ07283 1943 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 GPR15P49685 360 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SULT2A1Q06520 285 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 NAT16Q8N8M0 369 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 ATL1Q8WXF7 558 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SEPHS2Q99611 448 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 SRRDQ9UH36 339 aa21.39■■□□□ 1.02
LRP5-201ENST00000294304 QSOX1O00391 747 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 MYO19Q96H55 970 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 STK39Q9UEW8 545 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 C5orf60A6NFR6 353 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 DYRK3O43781 588 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 PDE5AO76074 875 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 MLYCDO95822 493 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ADH1CP00326 375 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 PSMC3P17980 439 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 S100A3P33764 101 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 CCT8P50990 548 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 RABGGTBP53611 331 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ATP6V0D1P61421 351 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 C11orf74Q86VG3 221 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 SLC9A7Q96T83 725 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 PLD3Q8IV08 490 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 COPS8Q99627 209 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 GBA3Q9H227 469 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 RNF39Q9H2S5 420 aa21.39■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 INPP4BO15327 924 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 GNRH1P01148 92 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 TRAF2Q12933 501 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 LIPMQ5VYY2 423 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 SYT12Q8IV01 421 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 TLE6Q9H808 572 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 MAGEC1O60732 1142 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 FASP25445 335 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 FAM151BQ6UXP7 276 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 CCL16O15467 120 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 AP2A1O95782 977 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 NEK3P51956 506 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 NAA20P61599 178 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ZBTB17Q13105 803 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ZNF398Q8TD17 642 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 NR2E1Q9Y466 385 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 FTH1P02794 183 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 PPP2R1BP30154 601 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 IZUMO2Q6UXV1 221 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 ARPINQ7Z6K5 226 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 CYP4Z1Q86W10 505 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 MAGED4Q96JG8 741 aa21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 GRM6O15303 877 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.019e-8■■□□□ 12.1
LRP5-201ENST00000294304 RNF43Q68DV7 783 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.37■■□□□ 1.01
LRP5-201ENST00000294304 RBFAQ8N0V3 343 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms