RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 CA12O43570 354 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ITGA2BP08514 1039 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TNFRSF8P28908 595 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 XYLT1Q86Y38 959 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 NETO2Q8NC67 525 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ITFG1Q8TB96 612 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MYO19Q96H55 970 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 C12orf42Q96LP6 360 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FYNP06241 537 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MC4RP32245 332 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MYOCQ99972 504 aa20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 H3BN98 237 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PEX11AO75192 247 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 BANF1O75531 89 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 IFNA16P05015 189 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 INHAP05111 366 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ANXA6P08133 673 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ANGPT1Q15389 498 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 KCNH1O95259 989 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 C1RP00736 705 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 HSMCR30P0CW71 290 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PRKAG1P54619 331 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PARP15Q460N3 678 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CPA6Q8N4T0 437 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RPTORQ8N122 1335 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 E7ENQ6 273 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FFAR3O14843 346 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SYN3O14994 580 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CCL16O15467 120 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GPR42O15529 346 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 LRPAP1P30533 357 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 IFNGR2P38484 337 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 STK32CQ86UX6 486 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 IRGQQ8WZA9 623 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GLMNQ92990 594 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 NDUFA13Q9P0J0 144 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 DUPD1Q68J44 220 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SAR1AQ9NR31 198 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.38■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 URADA6NGE7 173 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ISM1B1AKI9 464 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MDM4O15151 490 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 APODP05090 189 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GRIA4P48058 902 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PRKCZQ05513 592 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ACBD6Q9BR61 282 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 KCND1Q9NSA2 647 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 AGRPO00253 132 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 HS6ST1O60243 411 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 KELP23276 732 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FLT3P36888 993 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SLC9A5Q14940 896 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 LUZP2Q86TE4 346 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CYP4X1Q8N118 509 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms