RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 C7orf31Q8N865 590 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 KDM1BQ8NB78 822 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 SLC22A2O15244 555 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 GABBR2O75899 941 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 DDHD2O94830 711 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 IDO1P14902 403 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 NME5P56597 212 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 PRPSAP1Q14558 356 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 PLCL1Q15111 1095 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 TBCELQ5QJ74 424 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 IL31Q6EBC2 164 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 KCNMB4Q86W47 210 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 TCF12Q99081 682 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 UBP1Q9NZI7 540 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 BFARQ9NZS9 450 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.9□□□□□ -0.02
MSI1-201ENST00000257552 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CABYRO75952 493 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 KCNH1O95259 989 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 STAG3L1P0CL83 205 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 LCP1P13796 627 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ATP6V1B2P21281 511 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PROZP22891 400 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ARL4AP40617 200 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 STX5Q13190 355 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 LRP8Q14114 963 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FZD8Q9H461 694 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ASB14A6NK59 587 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 H3BRB1 525 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 DLGAP1O14490 977 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MRASO14807 208 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TRIM24O15164 1050 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MERTKQ12866 999 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CXorf38Q8TB03 319 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ISL2Q96A47 359 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SETD4Q9NVD3 440 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CDH7Q9ULB5 785 aa14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GLTPD2A6NH11 291 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 DPYSL4O14531 572 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CLOCKO15516 846 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GPC4O75487 556 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ATP6AP2O75787 350 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NXNL1Q96CM4 212 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 C9JVG2 144 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TIMM44O43615 452 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 E2F6O75461 281 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GSTT2P0CG29 244 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GSTT2BP0CG30 244 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CNSTQ6PJW8 725 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 LRCH3Q96II8 777 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 IL22Q9GZX6 179 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MID2Q9UJV3 735 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CROTQ9UKG9 612 aa14.88□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 UBDO15205 165 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms