RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.35■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SGSM3Q96HU1 749 aa21.35■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 PIDD1Q9HB75 910 aa21.35■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.35■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 INSIG1O15503 277 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 ITGA2BP08514 1039 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 QPCTQ16769 361 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CHKBQ9Y259 395 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 RFXAPO00287 272 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 GP5P40197 560 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 NAB1Q13506 487 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 MTBPQ96DY7 904 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CPNE1Q99829 537 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 TREX1Q9NSU2 369 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SUFUQ9UMX1 484 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 KCTD3Q9Y597 815 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.34■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 CCL22O00626 93 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 FAM107AO95990 144 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SLC18A1P54219 525 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 MPP7Q5T2T1 576 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 LEMD2Q8NC56 503 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 APOPT1Q96IL0 206 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 FEM1CQ96JP0 617 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 SMIM14Q96QK8 99 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
RFXAP-201ENST00000255476 FOXN2P32314 431 aa21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 FIBINQ8TAL6 211 aa21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 TRIB3Q96RU7 358 aa21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 LHX3Q9UBR4 397 aa21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 CDH22Q9UJ99 828 aa21.33■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 HEATR9A2RTY3 570 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 PDHA1P08559 390 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 GMPRP36959 345 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 CCT5P48643 541 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 NEK3P51956 506 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 ABHD8Q96I13 439 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 RBBP8Q99708 897 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 APOL5Q9BWW9 433 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 TPP1O14773 563 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 ZWINTO95229 277 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 CYBBP04839 570 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 DRD4P21917 467 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 CTBP1Q13363 440 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 PTPRCAPQ14761 206 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF77Q15935 545 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 HAUS2Q9NVX0 235 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 DPP7Q9UHL4 492 aa21.32■■□□□ 1
RFXAP-201ENST00000255476 WDR91A4D1P6 747 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms