RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM199	Q8N511	208 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR52B2	Q96RD2	323 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf21	Q9H246	121 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	AURKA	O14965	403 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PSMD3	O43242	534 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ANXA9	O76027	345 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TBX18	O95935	607 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TYMP	P19971	482 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATP6V1C1	P21283	382 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	VHL	P40337	213 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC1A2	P43004	574 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	GRIA4	P48058	902 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	COPA	P53621	1224 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	USP46	P62068	366 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	FPGS	Q05932	587 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	DLG1	Q12959	904 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SEPT6	Q14141	434 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CFAP157	Q5JU67	520 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF280D	Q6N043	979 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SCYL1	Q96KG9	808 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	UROC1	Q96N76	676 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	OMD	Q99983	421 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		7.58	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYLK	Q15746	1914 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM114	B3SHH9	223 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901		J3KR12	359 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	AP3B1	O00203	1094 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NEMP1	O14524	444 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NBN	O60934	754 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CIB2	O75838	187 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SOAT2	O75908	522 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PDE5A	O76074	875 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	CNTN5	O94779	1100 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PDHA1	P08559	390 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	OR1G1	P47890	313 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NAGLU	P54802	743 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ACTR3	P61158	418 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MAX	P61244	160 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	AFMID	Q63HM1	303 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	LZTR1	Q8N653	840 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NXNL1	Q96CM4	212 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYO7A	Q13402	2215 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	MYO9B	Q13459	2157 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901		F8W8V4	182 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	NEBL	O76041	1014 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	UPP2	O95045	317 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PIGN	O95427	931 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	PEX11B	O96011	259 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	EPHA3	P29320	983 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	GCK	P35557	465 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	EPHB1	P54762	984 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	GEM	P55040	296 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLC12A1	Q13621	1099 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	IHH	Q14623	411 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ALF	Q53S48	1182 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
SAMMSON-222	ENST00000641901	LIPM	Q5VYY2	423 aa		7.57	□□□□□ -1.2

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