RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	USP45	Q70EL2	814 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CENPU	Q71F23	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	BAP1	Q92560	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	REPS1	Q96D71	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KRT12	Q99456	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		H7C1Q1	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GYG2	O15488	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TSPAN1	O60635	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PMPCB	O75439	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SYP	P08247	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NFIC	P08651	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GJA1	P17302	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	UBE2S	Q16763	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FKBP9	O95302	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CNR2	P34972	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	UBE2K	P61086	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GRIN1	Q05586	938 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	POLE	Q07864	2286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DGCR6	Q14129	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADAM2	Q99965	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MYLK	Q15746	1914 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FSBP	O95073	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PRNP	P04156	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NPR3	P17342	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CASP5	P51878	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	INSC	Q1MX18	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PARP15	Q460N3	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ACSL4	O60488	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HSD3B1	P14060	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ALOX12	P18054	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CXCR2	P25025	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINA4	P29622	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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