RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMPSTE24O75844 475 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-217ENST00000629983 ARF5P84085 180 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-217ENST00000629983 USP53Q70EK8 1073 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-217ENST00000629983 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 EXTL1Q92935 676 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPTQ96BT3 561 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM51Q9NW97 253 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF212Q9UDV6 495 aa27.75■■■□□ 2.03
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