RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CDKN3Q16667 212 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEB5Q9BZ81 275 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 DACH1Q9UI36 760 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 C2CD4BA6NLJ0 364 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 KRIT1O00522 736 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TPP1O14773 563 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 LRIG2O94898 1065 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 POP4O95707 220 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 UGT2B4P06133 528 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TGM2P21980 687 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CDR2Q01850 454 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ISXQ2M1V0 245 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 MYLK3Q32MK0 819 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GUSBP11Q6P575 273 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 STRADAQ7RTN6 431 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 LMX1AQ8TE12 382 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CENPTQ96BT3 561 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF26Q96DR7 871 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ASCL3Q9NQ33 180 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF462Q96JM2 2506 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CPED1A4D0V7 1026 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 AREL1O15033 823 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 RAMP2O60895 175 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GFPT2O94808 682 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNB2P17787 502 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN9P43378 593 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 FMO1Q01740 532 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB133Q30KQ1 61 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 PCSK4Q6UW60 755 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 JOSD2Q8TAC2 188 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GPT2Q8TD30 523 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 BTN2A2Q8WVV5 523 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D31Q96DN5 1066 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL32Q96NJ5 620 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 IL12RB2Q99665 862 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GANQ9H2C0 597 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 IGF2-ASQ6U949 168 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC185Q8N715 623 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 SPASTQ9UBP0 616 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 KDELR3O43731 214 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GJB6O95452 261 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 HDAC4P56524 1084 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 PTK2BQ14289 1009 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 NR0B2Q15466 257 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 BROXQ5VW32 411 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GDPD4Q6W3E5 623 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TTC7BQ86TV6 843 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 RBFAQ8N0V3 343 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF843Q8N446 348 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 GRAMD1AQ96CP6 724 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 BOCQ9BWV1 1114 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 THSD1Q9NS62 852 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 GCATO75600 419 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 IGFALSP35858 605 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 THOP1P52888 689 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 UCNP55089 124 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS3P57727 454 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 YPEL5P62699 121 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 PTP4A2Q12974 167 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 VPS36Q86VN1 386 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 FAM172AQ8WUF8 416 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 NTAN1Q96AB6 310 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TBATAQ96M53 351 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SATB2Q9UPW6 733 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 RP1P56715 2156 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 LMO7DNF2Z398 122 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 BUB1O43683 1085 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 MMP20O60882 483 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 TMCC1O94876 653 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 SOX5P35711 763 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 KLK7P49862 253 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRF-216ENST00000617451 JAM2P57087 298 aa25.25■■□□□ 1.63
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