RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRN4Q8WUT4 740 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PEBP4Q96S96 227 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM62Q9BVG3 475 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PARD6AQ9NPB6 346 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 HAUS2Q9NVX0 235 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SIGLEC16A6NMB1 481 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CBX4O00257 560 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LRIG2O94898 1065 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DLDP09622 509 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRNA3P32297 505 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ADRA1BP35368 520 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ACVRL1P37023 503 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SCTRP47872 440 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SPDYCQ5MJ68 293 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf63Q6NUN7 778 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 FIBINQ8TAL6 211 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TNKS2Q9H2K2 1166 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZWILCHQ9H900 591 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP3K6O95382 1288 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A3P11169 496 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNJ1P48048 391 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SEL1L2Q5TEA6 688 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TP53INP2Q8IXH6 220 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GANCQ8TET4 914 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO19Q96H55 970 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SERGEFQ9UGK8 458 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 USP18Q9UMW8 372 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 STARD13Q9Y3M8 1113 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 COMMD10Q9Y6G5 202 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SIN3BO75182 1162 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PYGMP11217 842 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 GKP32189 559 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP13P45452 471 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TRPC1P48995 793 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 STARD3Q14849 445 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RABGAP1LQ5R372 815 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LAYNQ6UX15 382 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZVU0 165 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 BEND5Q7L4P6 421 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC25Q86WR0 208 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 AHI1Q8N157 1196 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 NELL1Q92832 810 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PGM2Q96G03 612 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LMLNQ96KR4 655 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 FEM1AQ9BSK4 669 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNH6Q9H252 994 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM74BQ9NUR3 256 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB23Q9ULC3 237 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DOCK9Q9BZ29 2069 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GVM2 712 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 TCAF2A6NFQ2 919 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 SPOPO43791 374 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 IL4RP24394 825 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 NRLP54845 237 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 DRG2P55039 364 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC38Q502W7 563 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ARTNQ5T4W7 220 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 UCMAQ8WVF2 138 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 MRGPRX3Q96LB0 322 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PCYOX1Q9UHG3 505 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 LILRB5O75023 590 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RTN2O75298 545 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 RHOCP08134 193 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 ITPKAP23677 461 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 CTNNA2P26232 953 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHB2P29323 1055 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX5P50542 639 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 NUBP1P53384 320 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-209ENST00000607882 HADHBP55084 474 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms