RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL12RB1	P42701	662 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFRSF4	P43489	277 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNT3A	P56704	352 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SKOR1	P84550	965 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCSK7	Q16549	785 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	C2orf27A	Q580R0	203 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOOK3	Q86VS8	718 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM3C	Q92520	227 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RUBCN	Q92622	972 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TADA1	Q96BN2	335 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	APOL2	Q9BQE5	337 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM245	Q9H330	911 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD320	Q9NPF0	282 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	VPS45	Q9NRW7	570 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAB21	Q9UL25	225 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGSF6	O95976	241 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPSB2	P20231	275 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	DRD1	P21728	446 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIE1	P35590	1138 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GEM	P55040	296 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPSAB1	Q15661	275 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDELC1	Q6UW63	502 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRL	Q86TD4	932 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHPF	Q8IZ52	775 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRN2	Q92932	1015 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		9.27	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	AVIL	O75366	819 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGT	P01019	485 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CES1	P23141	567 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRKCH	P24723	683 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFRSF8	P28908	595 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CDK16	Q00536	496 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPP3	Q13368	585 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CARD16	Q5EG05	197 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GJD3	Q8N144	294 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM1B	Q8NB78	822 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHST14	Q8NCH0	376 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	VOPP1	Q96AW1	172 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FMO2	Q99518	471 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GSR	P00390	522 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBB	P07437	444 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	WAS	P42768	502 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP1S1	P61966	158 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAV1	Q03135	178 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYLK3	Q32MK0	819 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF534	Q76KX8	674 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MSANTD3	Q96H12	275 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SERPINB12	Q96P63	405 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRBA1	A5PL33	1030 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	NDC80	O14777	642 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	SUN1	O94901	812 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM153B	P0C7A2	387 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCM3	P25205	808 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADRA1A	P35348	466 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSNK1D	P48730	415 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCIN	Q13939	588 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM153C	Q494X1	144 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCU	Q8NE86	351 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	FICD	Q9BVA6	458 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		9.26	□□□□□ -0.93
EFTUD2-223	ENST00000592576	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		9.26	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms