RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592561.5

PSMD8-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 8, human

TSL 2

Gene PSMD8, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD8-208	ENST00000592561	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CAV1	Q03135	178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	XRCC4	Q13426	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	DLG2	Q15700	870 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CRY1	Q16526	586 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM153C	Q494X1	144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561		A0A1W2PQF6	199 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	MATN3	O15232	486 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TTI1	O43156	1089 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	GFRA3	O60609	400 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TMCC1	O94876	653 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	NUDT17	P0C025	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HLA-E	P13747	358 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	AVPR2	P30518	371 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HSD17B3	P37058	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PTGIR	P43119	386 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CCR3	P51677	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	DGKE	P52429	567 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	LMNB2	Q03252	620 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	STARD3	Q14849	445 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CYTH1	Q15438	398 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF366	Q8N895	744 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	MAML1	Q92585	1016 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FMO2	Q99518	471 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	LGMN	Q99538	433 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PRRX2	Q99811	253 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	PLAA	Q9Y263	795 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	NUP205	Q92621	2012 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ESYT3	A0FGR9	886 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	MCF2L	O15068	1137 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	SIN3B	O75182	1162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	GSR	P00390	522 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CCNB1	P14635	433 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	VAV1	P15498	845 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ITIH2	P19823	946 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CXCL12	P48061	93 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	RENBP	P51606	427 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	AP1B1	Q10567	949 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TCF15	Q12870	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMD8-208	ENST00000592561	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms