RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.46□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 COL6A3P12111 3177 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 OBSL1O75147 1896 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEB16A2A368 324 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ANHXE9PGG2 379 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 FAM72CH0Y354 149 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RNF103O00237 685 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GFRA2O00451 464 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 CACNG3O60359 315 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GREM1O60565 184 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PRAMEF11O60813 436 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 EPOP01588 193 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ADH5P11766 374 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MLNP12872 115 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 CSNK1DP48730 415 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GEMP55040 296 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ST8SIA6P61647 398 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GUCY2DQ02846 1103 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GBE1Q04446 702 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 C2orf54Q08AI8 447 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF235Q14590 738 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 DHCR24Q15392 516 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 DUPD1Q68J44 220 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PID1Q7Z2X4 250 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 FAM72BQ86X60 149 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PDIK1LQ8N165 341 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MCUQ8NE86 351 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ING5Q8WYH8 240 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MAML1Q92585 1016 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 DNASE1L2Q92874 299 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 IGSF8Q969P0 613 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 P2RY11Q96G91 374 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A12Q96S37 553 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 LRRC1Q9BTT6 524 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 SPON2Q9BUD6 331 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RAB21Q9UL25 225 aa7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 NOTCH4Q99466 2003 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MAN2B1O00754 1011 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TTI1O43156 1089 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RAD51CO43502 376 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MFSD11O43934 449 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MAFKO60675 156 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TBX10O75333 385 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PPFIA2O75334 1257 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 SPAG6O75602 509 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TYRP14679 529 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TSHRP16473 764 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GJA1P17302 382 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 TPSB2P20231 275 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 KCNA5P22460 613 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 SLC6A4P31645 630 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 LTBRP36941 435 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEA6P43360 314 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MMP13P45452 471 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 NTHL1P78549 312 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GPS1Q13098 491 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 GPS2Q13227 327 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 MPP3Q13368 585 aa7.44□□□□□ -1.22
SMAD4-210ENST00000590061 RUNX3Q13761 415 aa7.44□□□□□ -1.22
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