RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ANLNQ9NQW6 1124 aa25.82■■□□□ 1.72
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CAPNS1-204ENST00000587718 LRIG2O94898 1065 aa25.82■■□□□ 1.72
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CAPNS1-204ENST00000587718 VANGL2Q9ULK5 521 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 BPGMP07738 259 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A3P11169 496 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMC3P17980 439 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEA12P43365 314 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 ARFIP2P53365 341 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-204ENST00000587718 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.729e-8■■■■■ 39.8
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