RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 TMPRSS12Q86WS5 348 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 PROSER1Q86XN7 944 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 SLC25A45Q8N413 288 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 TSC1Q92574 1164 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 BMFQ96LC9 184 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 DSPP15924 2871 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.79■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 RNF8O76064 485 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 CKMT2P17540 419 aa22.79■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 HS1BP3Q53T59 392 aa22.79■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 NETO2Q8NC67 525 aa22.79■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.79■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 POM121BA6NF01 834 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 TRABD2BA6NFA1 517 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 SKILP12757 684 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 JUPP14923 745 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 IFT43Q96FT9 208 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CLN3-215ENST00000565236 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.78■■□□□ 1.24
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CLN3-215ENST00000565236 FFAR2O15552 330 aa22.75■■□□□ 1.23
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CLN3-215ENST00000565236 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 DAB2P98082 770 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 FIGNQ5HY92 759 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 OR4C6Q8NH72 309 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN3-215ENST00000565236 EXOC2Q96KP1 924 aa22.75■■□□□ 1.23
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