RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DLG3	Q92796	817 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		18.62	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	GPR182	O15218	404 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	B3GAT3	O94766	335 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ARNT	P27540	789 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SLC1A2	P43004	574 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH1A3	P47895	512 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CNGA3	Q16281	694 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP10	Q6VN20	620 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	KDM1B	Q8NB78	822 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RCN3	Q96D15	328 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CATSPER2	Q96P56	530 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559		Q9H521	79 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CPA4	Q9UI42	421 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CCR10	P46092	362 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	GRM2	Q14416	872 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	NEPRO	Q6NW34	567 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PKMYT1	Q99640	499 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	WDR41	Q9HAD4	459 aa		18.61	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K13	O43283	966 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PMPCB	O75439	489 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ME2	P23368	584 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RAB27A	P51159	221 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	THOP1	P52888	689 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R39	P59534	338 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TSPY1	Q01534	308 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AFMID	Q63HM1	303 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MFN1	Q8IWA4	741 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MOCOS	Q96EN8	888 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LRGUK	Q96M69	825 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		18.6	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	HEATR9	A2RTY3	570 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559		M0QZQ0	153 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF623	O75123	536 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DQB2	P05538	268 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CPB1	P15086	417 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF460	Q14592	562 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	KLC3	Q6P597	504 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SH3GL3	Q99963	347 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	AP1G1	O43747	822 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CLCN2	P51788	898 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	DLG1	Q12959	904 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	PDK3	Q15120	406 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	CCL14	Q16627	93 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	LIN52	Q52LA3	116 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	POMK	Q9H5K3	350 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ACSS2	Q9NR19	701 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.57
RRN3-205	ENST00000563559	RGS2	P41220	211 aa		18.58	■□□□□ 0.57

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