RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM193A	P78312	1265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	TLE2	Q04725	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	KLRC3	Q07444	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	KAT2B	Q92831	832 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	PMM1	Q92871	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	EVPL	Q92817	2033 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A0D9SFI3	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	AKR1A1	P14550	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MX1	P20591	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS41	P49754	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	KCTD2	Q14681	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SNX22	Q96L94	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RRH	O14718	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MT-ND5	P03915	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ASGR1	P07306	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CLTB	P09497	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	MATN1	P21941	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	PEX2	P28328	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	DUSP1	P28562	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NOV	P48745	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ACLY	P53396	1101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	BEX3	Q00994	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TFAP4	Q01664	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NAPB	Q9H115	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS11-208	ENST00000559557	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms