RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIA4P48058 902 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ELP6Q0PNE2 266 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 MARC1Q5VT66 337 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 FEM1CQ96JP0 617 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF157Q96PX1 679 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PSKH2Q96QS6 385 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 LNP1A1A4G5 178 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC66A2RUB6 948 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 C16orf96A6NNT2 1141 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NEMP1O14524 444 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP33O14559 1287 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 APOL1O14791 398 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT86O43790 486 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 DFNA5O60443 496 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT2B4P06133 528 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT10P13645 584 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CA4P22748 312 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 IL4RP24394 825 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CCNCP24863 283 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 GARSP41250 739 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NR2C2P49116 596 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 COPS2P61201 443 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 BCL2L1Q07817 233 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 OVGP1Q12889 678 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CYTH1Q15438 398 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RAD9BQ6WBX8 426 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 SRLQ86TD4 932 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RCOR2Q8IZ40 523 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TPCN2Q8NHX9 752 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA1524Q8TCG1 905 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 FERMT1Q9BQL6 677 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CAPN10Q9HC96 672 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 LHX3Q9UBR4 397 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC30A4O14863 429 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 LATO43561 262 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 MAFKO60675 156 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH8O95206 1070 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CD48P09326 243 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ENGP17813 658 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 MMP13P45452 471 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ID4P47928 161 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 C21orf59P57076 290 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT2Q10471 571 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 MMRN1Q13201 1228 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PDK1Q15118 436 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC6Q16204 474 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ERAP2Q6P179 960 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 IQCHQ86VS3 1027 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 HORMAD1Q86X24 394 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RFX6Q8HWS3 928 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 EXD1Q8NHP7 514 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ARRDC3Q96B67 414 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TSGA13Q96PP4 275 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 MATN3O15232 486 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 MFSD11O43934 449 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 OPHN1O60890 802 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 SOCS5O75159 536 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV4-34P06331 123 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TNNT1P13805 278 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TGM2P21980 687 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 MAOBP27338 520 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 IRX4P78413 519 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC14A1Q13336 389 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-205ENST00000558534 STPG1Q5TH74 334 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms