RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557758.1

PRMT5-227, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-227	ENST00000557758	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRMT5-227	ENST00000557758	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRMT5-227	ENST00000557758	AOX1	Q06278	1338 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	USP6	P35125	1406 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758		F5H697	171 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	QSOX1	O00391	747 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	PLOD2	O00469	737 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	PROM1	O43490	865 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	STX6	O43752	255 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CEP104	O60308	925 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	STAM2	O75886	525 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	LAG3	P18627	525 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	FMO4	P31512	558 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TXK	P42681	527 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	MTHFR	P42898	656 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CBX3	Q13185	183 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TUBB2A	Q13885	445 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CBFB	Q13951	182 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	RNF151	Q2KHN1	245 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	FBXO43	Q4G163	708 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	METRNL	Q641Q3	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TSSK4	Q6SA08	328 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	SYT12	Q8IV01	421 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	DPP10	Q8N608	796 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	GTF3C6	Q969F1	213 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	IWS1	Q96ST2	819 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	NEU1	Q99519	415 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	GCM1	Q9NP62	436 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	LIPT1	Q9Y234	373 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	NR2E1	Q9Y466	385 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	SHPRH	Q149N8	1683 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TMEM94	Q12767	1356 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758		A0A1W2PRX2	142 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	KRT87P	A6NCN2	255 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	LRRC53	A6NM62	1247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	OR6C76	A6NM76	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758		A8MVJ9	347 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	CA12	O43570	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TADA2A	O75478	443 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	OLFM2	O95897	454 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	FYN	P06241	537 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	KRT10	P13645	584 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	MC5R	P33032	325 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	LIMS1	P48059	325 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TDO2	P48775	406 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	LIMK1	P53667	647 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	GRAP	Q13588	217 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	RUNX2	Q13950	521 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	IL11RA	Q14626	422 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	IL13RA2	Q14627	380 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	MEP1B	Q16820	701 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	IGSF11	Q5DX21	431 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ATG9B	Q674R7	924 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TREML4	Q6UXN2	200 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	VPS52	Q8N1B4	723 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRMT5-227	ENST00000557758	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		5.76	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms