RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 STAT1P42224 750 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 FMO1Q01740 532 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 SYCP1Q15431 976 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 CDKN3Q16667 212 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 RAB6CQ53S08 254 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 MANEALQ5VSG8 457 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 BROXQ5VW32 411 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 NLRP14Q86W24 1093 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 FAM72BQ86X60 149 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 DENND6BQ8NEG7 585 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 LMX1AQ8TE12 382 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 GPR27Q9NS67 375 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.28□□□□□ -1.08
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COCH-211ENST00000557065 TMEM131Q92545 1883 aa8.28□□□□□ -1.08
COCH-211ENST00000557065 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.27□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 RPIAP49247 311 aa8.27□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 WDR59Q6PJI9 974 aa8.27□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 LGMNQ99538 433 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.27□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.27□□□□□ -1.09
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