RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 ABL2P42684 1182 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 CA9Q16790 459 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 HS1BP3Q53T59 392 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 TTC7BQ86TV6 843 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 FAM174AQ8TBP5 190 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 EXOC2Q96KP1 924 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 PEBP4Q96S96 227 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM7Q9C029 511 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 ITM2BQ9Y287 266 aa24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 CEP295Q9C0D2 2601 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 A0A1W2PQJ5 194 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 XPAP23025 273 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 NDST2P52849 883 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 DNAJC3Q13217 504 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 DHRS13Q6UX07 377 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 Q6ZSR6 202 aa24.79■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 IGLON5A6NGN9 336 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 DKK1O94907 266 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 RFX8Q6ZV50 586 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC19Q9H756 370 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 GGT7Q9UJ14 662 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa24.78■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 FPGTO14772 594 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 RFPL3O75679 317 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 FGL2Q14314 439 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 NFKBIBQ15653 356 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 CFAP58Q5T655 872 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 IQCDQ96DY2 449 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 ISCUQ9H1K1 167 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 SP110Q9HB58 689 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 IFNKQ9P0W0 207 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.77■■□□□ 1.56
PRKCH-216ENST00000555542 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 FRYQ5TBA9 3013 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 J3KR12 359 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 DFFAO00273 331 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 RAD51BO15315 384 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 LRCH4O75427 683 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SERPING1P05155 500 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ERCC2P18074 760 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ZBED6P86452 979 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CYTH1Q15438 398 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CXorf40AQ8TE69 158 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ZWILCHQ9H900 591 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 LHX3Q9UBR4 397 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.76■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 FAM149AA5PLN7 773 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 POM121BA6NF01 834 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 INSIG1O15503 277 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 FFAR2O15552 330 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PRAMEF11O60813 436 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PIGNO95427 931 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 TPM3P06753 285 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PBX1P40424 430 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 RABIFP47224 123 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 GRM3Q14832 879 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 HGSNATQ68CP4 663 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 MARCH9Q86YJ5 346 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PAF1Q8N7H5 531 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 BMFQ96LC9 184 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PDFQ9HBH1 243 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SPEGQ15772 3267 aa24.75■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 H3BRJ5 948 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 PALMO75781 387 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 C1SP09871 688 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 CDK4P11802 303 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 DGKAP23743 735 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ARL4AP40617 200 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ACADVLP49748 655 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 ACAP1Q15027 740 aa24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PRKCH-216ENST00000555542 SMTNL2Q2TAL5 461 aa24.74■■□□□ 1.55
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