RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	WDCP	Q9H6R7	721 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FZD3	Q9NPG1	666 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	IL17B	Q9UHF5	180 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ITPR1	Q14643	2758 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQC6	194 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ILVBL	A1L0T0	632 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	POM121B	A6NF01	834 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	DRGX	A6NNA5	263 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	LMO7DN	F2Z398	122 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PLD2	O14939	933 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	MUSK	O15146	869 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CBFA2T2	O43439	604 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SNAP91	O60641	907 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	LEFTY1	O75610	366 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	F9	P00740	461 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ERBB2	P04626	1255 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ANXA6	P08133	673 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	RHOC	P08134	193 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	MYF5	P13349	255 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ADRB3	P13945	408 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	RRM1	P23921	792 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NUMB	P49757	651 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	BLK	P51451	505 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZNF75D	P51815	510 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PFN3	P60673	137 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	YPEL5	P62699	121 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FMO1	Q01740	532 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NME3	Q13232	169 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CLN3	Q13286	438 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SPIDR	Q14159	915 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TAF5	Q15542	800 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CARD16	Q5EG05	197 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	GUSBP11	Q6P575	273 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	C14orf80	Q86SX3	495 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	VSTM4	Q8IW00	320 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SPC24	Q8NBT2	197 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	LMX1A	Q8TE12	382 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CPXM1	Q96SM3	734 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PSMB7	Q99436	277 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SEMA3C	Q99985	751 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	STRADB	Q9C0K7	418 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SIK2	Q9H0K1	926 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SYNC	Q9H7C4	482 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	COX16	Q9P0S2	106 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	VPS51	Q9UID3	782 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PADI4	Q9UM07	663 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688		A0A0D9SEW6	157 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688		K7ERQ8	282 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688		M0QYT0	321 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688	NEMP1	O14524	444 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688	DAB1	O75553	588 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CS-233	ENST00000552688	TPM3	P06753	285 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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