RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SERPINF2P08697 491 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 DRD4P21917 467 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 WEE1P30291 646 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CDC25CP30307 473 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ADRA1AP35348 466 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CSKP41240 450 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MTA1Q13330 715 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PTPRRQ15256 657 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SHHQ15465 462 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 C16orf46Q6P387 395 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 KDELC1Q6UW63 502 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 BBS5Q8N3I7 341 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PTPRN2Q92932 1015 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CABS1Q96KC9 395 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 LRRC3Q9BY71 257 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ILVBLA1L0T0 632 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 GREM1O60565 184 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 GP5P40197 560 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CDK18Q07002 472 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 APCDD1Q8J025 514 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 KIFC1Q9BW19 673 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PIDD1Q9HB75 910 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ZNF358Q9NW07 568 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 STK39Q9UEW8 545 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SEPT3Q9UH03 358 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 IRAK3Q9Y616 596 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ARL5AQ9Y689 179 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 OR51F1A6NGY5 319 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 KDELR3O43731 214 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 DNAJC6O75061 913 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ZWINTO95229 277 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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CS-215ENST00000549143 ARF5P84085 180 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MPP1Q00013 466 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 POTEHQ6S545 545 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 RAPH1Q70E73 1250 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TEX26Q8N6G2 289 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MYLIPQ8WY64 445 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 APOPT1Q96IL0 206 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PDFQ9HBH1 243 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 VPS45Q9NRW7 570 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 AP3B1O00203 1094 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TMCC1O94876 653 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 OLFM2O95897 454 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 PTPN2P17706 415 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 TAC1P20366 129 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SERPINB9P50453 376 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 OVGP1Q12889 678 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 GPM6BQ13491 265 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 C5orf22Q49AR2 442 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 DCLK2Q8N568 766 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 NAT16Q8N8M0 369 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-215ENST00000549143 RIN3Q8TB24 985 aa8.51□□□□□ -1.05
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