RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCAPQ12770 1279 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPYSL3Q14195 570 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRD3Q15059 726 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LLGL1Q15334 1064 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R7Q15435 360 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCNG2Q16589 344 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DUSP6Q16828 381 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF43Q68DV7 783 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PACS1Q6VY07 963 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC185Q8N715 623 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RSAD2Q8WXG1 361 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF157Q96PX1 679 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PEBP4Q96S96 227 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB17Q9H0T7 212 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F5H5T6 163 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H7C0C1 242 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMPRSS2O15393 492 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCAM2O15394 837 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSI1O43347 362 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERLIN1O75477 346 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TADA3O75528 432 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCEA3O75764 348 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEBLO76041 1014 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBX18O95935 607 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCGB1D2O95969 90 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV3-25P01717 112 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOC2P02655 101 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CKMP06732 381 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POU2F2P09086 479 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHOXF2BP0C7M4 288 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IRF1P10914 325 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB6AP20340 208 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPHB2P29323 1055 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AVPR1AP37288 418 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COILP38432 576 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP5OP48047 213 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LIG3P49916 1009 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNX1Q13596 522 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TM4SF20Q53R12 229 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAAH2Q6GMR7 532 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AADACL2Q6P093 401 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMCO3Q6UWJ1 677 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BBS12Q6ZW61 710 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BNIPLQ7Z465 357 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IFT20Q8IY31 132 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LZTR1Q8N653 840 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RUBCNQ92622 972 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AZIN2Q96A70 460 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf74Q96LT6 269 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHOXF2Q9BQY4 288 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPCSQ9HAB8 311 aa5.75□□□□□ -1.49
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms