RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 SUPT3HO75486 399 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 KRT36O76013 467 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 OR5F1O95221 314 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PSMG1O95456 288 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 WEE2P0C1S8 567 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 S100A1P23297 94 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 ICAM3P32942 547 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PGM1P36871 562 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 SOX10P56693 466 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 RPL26P61254 145 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 CNTN2Q02246 1040 aa5.5□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 TRIM32Q13049 653 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PGM5Q15124 567 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 DUSP28Q4G0W2 176 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 CEP78Q5JTW2 689 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 RASIP1Q5U651 963 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 NIPA1Q7RTP0 329 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 NLRX1Q86UT6 975 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 PALM2Q8IXS6 379 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 LSMEM2Q8N112 164 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PRR18Q8N4B5 295 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 URGCPQ8TCY9 931 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 POMGNT1Q8WZA1 660 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 SGK3Q96BR1 496 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 ARL5BQ96KC2 179 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 ALPK3Q96L96 1907 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 RIT2Q99578 217 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 TSSK1BQ9BXA7 367 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 EURLQ9NYK6 297 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 SNX6Q9UNH7 406 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 MED16Q9Y2X0 877 aa5.5□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 TM9SF1O15321 606 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 YKT6O15498 198 aa5.49□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 CREB5Q02930 508 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 MAP7Q14244 749 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 HIF1AQ16665 826 aa5.49□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 CCDC14Q49A88 953 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 C2CD6Q53TS8 623 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.49□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 CARFQ8N187 725 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.49□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 CDKL2Q92772 493 aa5.49□□□□□ -1.53
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CKAP5-212ENST00000533413 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 GOLGA8RI6L899 631 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 TYROBPO43914 113 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 GREM1O60565 184 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 MAFKO60675 156 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 ZBED1O96006 694 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 CALCAP01258 141 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 LYNP07948 512 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 UNGP13051 313 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PCP4P48539 62 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 RTP1P59025 263 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 TAS2R40P59535 323 aa5.49□□□□□ -1.53
CKAP5-212ENST00000533413 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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