RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFAIP1Q13829 316 aa0.96□□□□□ -2.26
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XKR6Q5GH73 641 aa0.96□□□□□ -2.26
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa0.96□□□□□ -2.26
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1F2PQ96R84 312 aa0.95□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COLEC11Q9BWP8 271 aa0.95□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP0.95□□□□□ -2.26
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM181Q9P2C4 612 aa0.95□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CA14Q9ULX7 337 aa0.95□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa0.95□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASPDHA6ND91 283 aa0.94□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOCS6O14544 535 aa0.94□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNPH1O43598 174 aa0.94□□□□□ -2.26
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
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