RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCTD8Q6ZWB6 473 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 KMT5CQ86Y97 462 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF614Q8N883 585 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR2T6Q8NHC8 308 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL31RAQ8NI17 732 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPT2Q8TD30 523 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 CREB3L4Q8TEY5 395 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDCA5Q96FF9 252 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ST6GAL2Q96JF0 529 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAR2Q96K12 515 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF354BQ96LW1 612 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NT5C1BQ96P26 610 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAP3K14Q99558 947 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 PKP2Q99959 881 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZBTB26Q9HCK0 441 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC52A3Q9NQ40 469 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRDM8Q9NQV8 689 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANAPC11Q9NYG5 84 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMOD4Q9NZQ9 345 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ASIC3Q9UHC3 531 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 POMT2Q9UKY4 750 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC6A5Q9Y345 797 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 MOB4Q9Y3A3 225 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF462Q96JM2 2506 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 MST1RQ04912 1400 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 USP19O94966 1318 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNKSO95271 1327 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TENM4Q6N022 2769 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPIPB5A8MRT5 1133 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ISM1B1AKI9 464 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRR32B1ATL7 298 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPIPB4C9JG80 1138 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM178BH3BS89 294 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 J3KR12 359 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NPC1O15118 1278 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 RASA4O43374 803 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEP104O60308 925 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL33O95760 270 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM49P0CI25 452 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM49CP0CI26 452 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 HLA-DOBP13765 273 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM27P14373 513 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 BRAFP15056 766 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 CAPN2P17655 700 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGFBP2P18065 325 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 VCAM1P19320 739 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NCLP19338 710 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRKCHP24723 683 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTR1BP28222 390 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATICP31939 592 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 DPP6P42658 865 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 MMP14P50281 582 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLCNKBP51801 687 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 COX10Q12887 443 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPS1Q13098 491 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 GBX1Q14549 363 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 EFNB3Q15768 340 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TUBB8Q3ZCM7 444 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 C5orf22Q49AR2 442 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYTL3Q4VX76 610 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 C3orf38Q5JPI3 329 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATAT1Q5SQI0 421 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 PAQR6Q6TCH4 344 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 B3GNT9Q6UX72 402 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 UNC13DQ70J99 1090 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRT26Q7Z3Y9 468 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NECAB2Q7Z6G3 386 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM200AQ86VY9 491 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCNMB4Q86W47 210 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 HPS6Q86YV9 775 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMC8Q8IU68 726 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPATA22Q8NHS9 363 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 RASL10AQ92737 203 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 HPS3Q969F9 1004 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUDT22Q9BRQ3 303 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-287P-201ENST00000516230 MSTO1Q9BUK6 570 aa0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms