RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SPINT1O43278 529 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 BUB1O43683 1085 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ACTN2P35609 894 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 COPB1P53618 953 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 GSCP56915 257 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SYCP1Q15431 976 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa17.17■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 CDCP2Q5VXM1 449 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ZNF354CQ86Y25 554 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PYROXD2Q8N2H3 581 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NETO2Q8NC67 525 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 C3orf20Q8ND61 904 aa17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa17.17■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa17.17■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 TMCC1O94876 653 aa17.16■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 JUNDP17535 347 aa17.16■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D25Q3MII6 688 aa17.16■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 GDPD4Q6W3E5 623 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TTC7BQ86TV6 843 aa17.16■□□□□ 0.34
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HERC3-211ENST00000513325 ASB12Q8WXK4 309 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF26Q96DR7 871 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 KLC2Q9H0B6 622 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ABCG4Q9H172 646 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 PRORYQ9H606 182 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 USP29Q9HBJ7 922 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 EVA1BQ9NVM1 165 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 IGSF10Q6WRI0 2623 aa17.16■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CCP110O43303 1012 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 AQP9O43315 295 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ITIH2P19823 946 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 EPHB2P29323 1055 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CDKN3Q16667 212 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 VPS36Q86VN1 386 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 NEK11Q8NG66 645 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 IFI44Q8TCB0 444 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 LMX1AQ8TE12 382 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 CENPTQ96BT3 561 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 DEPDC7Q96QD5 511 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TTYH3Q9C0H2 523 aa17.15■□□□□ 0.34
HERC3-211ENST00000513325 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 CPED1A4D0V7 1026 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 RASA4BC9J798 803 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 RASA4O43374 803 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 CREB3O43889 395 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 MMP20O60882 483 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 USP12O75317 370 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 CSO75390 466 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 IGSF6O95976 241 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 MPOP05164 745 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 THOP1P52888 689 aa17.14■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 CCDC173Q0VFZ6 552 aa17.14■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 DNAJC24Q6P3W2 148 aa17.14■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 MAPK15Q8TD08 544 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.14■□□□□ 0.33
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HERC3-211ENST00000513325 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 IL12RB2Q99665 862 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 AGPAT1Q99943 283 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 ASXL3Q9C0F0 2248 aa17.14■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 FASNP49327 2511 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 LGALS16A8MUM7 142 aa17.13■□□□□ 0.33
HERC3-211ENST00000513325 INSIG1O15503 277 aa17.13■□□□□ 0.33
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